gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

作     者：李瑞瑞 张子晓 赵振华 韩威 向海 王钱保 黄正洋 李春苗 宗毅 黄华云 Li Ruirui

作者机构：江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125 佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室广东佛山528225 河北科技师范大学河北秦皇岛066600 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第52卷第5期

页      面：64-69页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-41-Z05) 江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目[编号:JBGS(2021)109、JBGS(2021)029] 国家家养动物种质库建设项目(编号:2023) 国家自然科学基金(编号:32102538) 

主　　题：gga-miR-26a 鸡 表达特性 靶基因 

摘      要：为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用,以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织,腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化,并利用生物信息学的方法,对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析。结果表明,gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异,S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡;腹脂组织中,gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P0.05);在脂肪细胞中,gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P0.05)。利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测,共预测到163个交集靶基因;GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达,进而调控鸡的脂肪沉积。综上所述,gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达,且具有显著的品种差异;gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程,PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因。