猪泛素化因子的筛选及生物信息学分析

作     者：李健 刘亚星 李超程 郭涛 韩雨松 张亚茹 王慧 张永生 贾斌 

作者机构：石河子大学动物科技学院新疆石河子832000 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2024年第60卷第5期

页      面：147-154页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：石河子大学高层次人才科研启动项目(2022ZK022) 猪性别控制技术应用与示范(校2022032) 

主　　题：猪 骨骼肌 FBXL家族 生物信息学分析 

摘      要：为探究影响猪骨骼肌发育的泛素化因子,本研究通过前期已获得的猪骨骼肌组织的转录组数据,与UniProt蛋白质序列和功能注释数据库中的猪泛素化因子进行比对,成功筛选出FBXL3、FBXL4、FBXL5等泛素化因子。通过生物信息学在线软件对一些关键泛素化因子FBXL3、FBXL4和FBXL6进行分析,得到其空间结构和理化性质等参数。结果显示:FBXL3、FBXL4和FBXL6蛋白均为不稳定的亲水蛋白,均不存在跨膜区域,FBXL3、FBXL4蛋白分别有44个和7个磷酸化位点,FBXL6无磷酸化位点,二级结构中无规则卷曲分别占比36.60%、38.33%、41.08%,FBXL6蛋白与FBXL3、FBXL7、FBXL8、FBXL12等多个泛素化蛋白相互作用。本研究成功对猪的泛素化因子进行了筛选,同时进行了系统的生物信息学分析,为解析泛素化因子对骨骼肌的调控作用提供了基础资料。