6株K亚群禽白血病病毒分离株的全基因组测序及遗传进化分析

作     者：游广炬 阿热阿依·海依拉提 李炜 李晓齐 高丽 曹红 王永强 郑世军 YOU Guangju;ARAY·Hayrat;LI Wei;LI Xiaoqi;GAO Li;CAO Hong;WANG Yongqiang;ZHENG Shijun

作者机构：中国农业大学动物医学院公共卫生安全全国重点实验室北京100193 

出 版 物：《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)

年 卷 期：2023年第31卷第6期

页      面：116-126页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：行业专项及国家蛋鸡产业技术体系项目(CARS-40) 

主　　题：禽白血病病毒 K亚群 重组毒株 全基因组测序 遗传进化分析 

摘      要：为研究目前中国临床流行的ALV毒株特征,我们采集临床上ALV P27阳性的鸡的血浆,接种DF-1细胞进行病毒分离,分离出6株外源性ALV毒株,并进一步对分离毒株进行前病毒全基因组测序。结果表明,6个ALV分离株的基因组结构均为典型的复制完整型C型逆转录病毒,缺乏病毒致癌基因,分离株DT190901基因组全长为7473 bp;DT190902和DT190905为7467 bp;DT190903和DT190906为7481 bp;DT190904为7493 bp,分离株间基因组序列同源性较高(98.6%~99.9%)。对6个ALV分离株与其他ALV毒株进行序列比较和遗传进化分析,结果表明,分离株的LTR、gag、pol及gp37基因与内源性ALV相比具有较高同源性(93.8%),gp85基因与ALV-K一致性较高(95.4%),属于新型ALV亚群(K亚群)遗传分支。分离株的LTR序列与内源性ALV相似,比其他外源性ALV亚群缺少一个CAAT Box、PRE Box、Y Box及CArG Box等转录调控元件。结果表明这6个分离株属于ALV-K亚群,为ALV-K与内源性ALV的重组毒株,其LTR序列与内源性ALV接近可能导致其复制能力及致病性降低。遗传进化分析表明,ALV-K已经在我国局部流行,并出现基因重组和突变毒株,应该引起重视并改进净化防控措施控制ALV-K流行。