基于比较转录组测序分析雨生红球藻对克氏原螯虾肝胰腺基因表达的影响
The impact of Haematococcus pluvialis on hepatopancreas geneexpression in Procambarus clarkii investigated throughcomparative transcriptome sequencing analysis作者机构:广西科技大学广西柳州545000 柳州市柳江区农业农村综合发展服务中心广西柳州545000 不详
出 版 物:《河北渔业》 (Hebei Fisheries)
年 卷 期:2024年第2期
页 面:1-6,28,F0003页
学科分类:090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学]
基 金:2022年广西农业科技自筹经费项目任务书(项目名称:稻田投喂发酵秸秆养鱼(螺)推广应用,任务书编号Z2022172) 2022年广西农业科技自筹经费项目任务书(项目名称:稻虾共生生态养殖病害防治技术的集成与示范,任务书编号Z2022173)
摘 要:为明确饲料中添加雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)肝胰腺基因表达的影响,以克氏原螯虾商业饲料作为基础饲料添加雨生红球藻,配置含有3‰雨生红球藻的试验饲料对克氏原螯虾进行为期45 d的喂养。基于RNA-seq技术对其肝胰腺的转录组数据进行分析,测序共获得44.61 Gb干净数据,Q30碱基百分比在92.46%以上。在FDR≤0.05且|log2FC|≥3的筛选条件下转录组测序分析共鉴定出895个差异表达基因。GO功能富集分析结果显示,差异表达基因主要在能量代谢过程上显著富集。KEGG通路富集分析结果显示,差异基因主要在能量代谢、免疫和神经传递相关通路中被显著富集。综上所述,饲料中添加3‰的雨生红球藻可能有助于克氏原螯虾提高抵抗病原体和外界环境变化的能力。