芥菜bZIP基因家族的鉴定和表达分析

作     者：代春艳 张笑晗 王晓丽 弓琼 苏醒 成耀华 张明政 于澄宇 Dai Chunyan;Zhang Xiaohan;Wang Xiaoli;Gong Qiong;Su Xing;Cheng Yaohua;Zhang Mingzheng;Yu Chengyu

作者机构：西北农林科技大学农学院杨凌712100 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第7期

页      面：2104-2118页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：陕西省重点研发计划项目(2021NY-074)资助 

主　　题：芥菜(Brassica juncea L.) bZIP 基因家族 表达分析 

摘      要：碱性亮氨酸拉链(bZIP)是一类广泛存在真核生物中的转录因子家族,参与多种植物生长发育及生物和非生物胁迫的响应过程,对下游许多基因的表达具有强烈调控作用。为了解芥菜bZIP基因家族的基因结构,成员之间的相互关系以及在非生物胁迫下的反应机制。本研究利用生物信息学方法,从Brassica Database (BRAD)数据库下载的芥菜基因组中鉴定到81个BjubZIP基因,其中34.57%的基因缺乏内含子,59.26%的BjubZIP等电点小于7,表明芥菜中有超过一半的bZIP蛋白为酸性蛋白,亚细胞定位预测所有的基因均位于细胞核。将81个BjubZIP进一步分为与拟南芥基因相对应的6个亚群,同一亚群的motif数量和基因结构高度相似。利用公共数据库中的芥菜转录组数据,对BjubZIP基因家族在干旱和高温胁迫下的表达分析,发现A亚群基因中的BjubZIP02、BjubZIP21、BjubZIP28、BjubZIP38、BjubZIP50、Bjub ZIP62、BjubZIP59在高温和干旱胁迫下均处于上调状态,推测芥菜中的这7个基因可能与拟南芥A亚群基因的功能相似,参与了在非生物胁迫下相应的生理过程。本研究结果可为今后芥菜bZIP家族成员的基因克隆和在胁迫反应中的功能研究提供参考。