乙、丙型肝炎病毒相关肝癌GEO芯片结合虚拟筛选探究差异基因及靶向治疗药物研究

作     者：郭志文 魏凤 

作者机构：酒泉市中医院 

出 版 物：《中医临床研究》 (Clinical Journal of Chinese Medicine)

年 卷 期：2024年

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

主　　题：生物信息学 GEO数据库 乙型肝炎、丙型肝炎病毒 肝癌 分子对接 虚拟筛选 

摘      要：目的：通过生物信息学方法筛选乙、丙型肝炎病毒相关肝细胞癌的关键致病基因及相关通路，探究其表达水平、致病机制、免疫浸润、突变及预后情况，并通过虚拟筛选技术筛选潜在的可用于肝癌靶向治疗的化合物。方法：通过数据集GSE44074分析乙、丙型肝炎病毒和肝癌组织的差异表达基因（Differentially Expressed Genes，DEGs）；对DEGs进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析，构建DEGs蛋白质-蛋白质相关作用网络并筛选肝癌发病关键基因；对关键基因进行蛋白质-蛋白质相关作用网络分析、预后分析、表达验证及免疫浸润；虚拟筛选潜在治疗乙、丙型肝炎病毒相关肝癌的化合物。结果：筛选得到显著性DEGs41个，主要涉及对异物刺激的反应、调控反应药，参与细胞色素P450对外源物质的代谢、视黄醇代谢等信号通路；筛选出10个关键基因，且10个关键基因高表达组的肝癌患者的总生存期均高于低表达组；关键基因表达与免疫细胞浸润密切相关；以关键基因ALB为靶点筛选得到30种化合物，并通过分子对接验证及ADMET预测，最终筛选出6种化合物可能成为通过靶点白蛋白（Albumin，ALB）干预乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒相关肝癌的潜在化合物。结论：本研究鉴定出了肝癌关键致病基因，其异常表达与肝癌的不良预后、免疫细胞浸润密切相关，筛选出潜在的治疗乙、丙型肝炎病毒相关肝癌化合物，研究结果可为肝癌的诊断、治疗及预后提供科学依据。