宁乡猪不同生长阶段结肠微生物菌群特征分析

作     者：弯梦辽 付鑫琳 王芳 尹业鑫 谭名洋 肖银涛 陈家顺 

作者机构：湖南农业大学动物科学技术学院动物营养基因组与种质创新研究中心湖南长沙410128 湖南省畜禽安全生产协同创新中心湖南长沙410128 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2023年第59卷第11期

页      面：224-230页

学科分类：090502[农学-动物营养与饲料科学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：“十四五”国家重点研发计划项目(2021YFD 1300403) 国家生猪产业技术体系建设专项(CARS-35) 湖南省自然科学基金青年基金项目(2022JJ40165) 湖南省大学生创新创业训练计划项目。 

主　　题：宁乡猪 结肠 不同生长阶段 微生物多样性 16S rDNA测序 

摘      要：本研究以宁乡花猪为实验对象,旨在通过16S rDNA高通量测序技术探究5个不同生长阶段(30、70、150、200、250日龄)结肠微生物菌群的结构及特征差异,分析各个阶段微生物组成及多样性。结果显示:宁乡猪结肠微生物多样性只在30日龄与200日龄间差异显著,而微生物丰度30日龄与70~250日龄间差异显著、70~150日龄与200日龄间差异显著;通过菌群分类学分析发现,在不同生长阶段结肠微生物菌群分布于23个门(Phylum)、41个纲(Class)、85个目(Order)、141个科(Family)、294个属(Genus);在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)与拟杆菌门(Bacteroidota)为宁乡猪结肠微生物主要优势菌门,梭杆菌门(Fusobacteriota)与互养菌门(Synergistota)只存在于30日龄中;在属水平,乳酸杆菌属(Lactobacillus)、颤螺旋菌科(Oscillospiraceae_UCG_005)、普式菌属(Prevotella)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium_sensu_stricto_1)、链球菌属(Streptococcus)为优势菌属;不同时期的特异菌群存在显著差异。LEfSe方法分析发现不同生长阶段肠道特异菌群不同,但含有较多如乳杆菌属(Lactobacillus)、柯林斯菌属(Collinsella)等有益菌。随着宁乡猪的生长发育,其肠道中厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度的增加和拟杆菌门(Bacteroidota)相对丰度的降低与脂肪沉积相关;变形菌门(Proteobacteria)与梭杆菌门(Fusobacteriota)相对丰度的降低与致病性相关;放线菌门(Actinobacteriota)相对丰度的增加与能量摄取和利用相关,说明宁乡猪肠道菌群结构随生长发育阶段的改变而发生相应变化。