基于网络和组学方法的产电微生物胞外电子传递研究进展

作     者：丁德武 张鵾 何小青 谢建明 DING Dewu;ZHANG Kun;HE Xiaoqing;XIE Jianming

作者机构：宜春学院数学与计算机科学学院宜春336000 池州学院材料与环境工程学院池州247000 东南大学生物科学与医学工程学院南京210096 东南大学生物电子学国家重点实验室南京210096 

出 版 物：《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期：2024年第41卷第1期

页      面：107-112页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(62161050) 安徽省教育厅自然科学重点项目(KJ2019A0865) 

主　　题：生物信息学 生物网络 组学方法 胞外电子传递 产电微生物 

摘      要：介绍产电微生物胞外电子传递(extracellular electron transfer,EET)研究的背景和意义,概述细胞色素c、菌毛蛋白、电子介体等多种分子在EET过程中的作用,综述近年来利用网络方法和组学方法研究产电微生物EET过程的相关工作。从蛋白网络、调控网络与整合网络等方面总结网络分析方法在关键电子传递分子识别、电子传递模块挖掘、电子传递途径推断等方面的应用;从基因组、转录组、蛋白组、多组学与宏组学等方面总结使用组学方法识别电子传递基因及其功能分析方面的研究;介绍整合生物网络与组学数据在产电微生物EET过程生物分子协调利用、关键基因与基因簇识别等方面的研究。探讨当前存在的问题,展望未来整合多种生物网络和组学数据开展产电微生物EET研究的方向。