小麦条锈菌新菌系CYR34中CDK5基因的克隆及生物信息学分析

作     者：蒋应磊 罗超 陈诗雯 邵欣 邹一萍 陶飞 薛应钰 JIANG Yinglei;LUO Chao;CHEN Shiwen;SHAO Xin;ZOU Yiping;TAO Fei;XUE Yingyu

作者机构：甘肃农业大学植物保护学院兰州730070 广西大学农学院南宁530004 南京农业大学生命科学学院南京210095 

出 版 物：《西北农业学报》 (Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica)

年 卷 期：2024年第33卷第1期

页      面：133-140页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：国家自然基金地区科学基金(32060595) 甘肃省青年基金(20JR10RA549) 甘肃农业大学人才专项(GAU-KYQD-2018-37) 

主　　题：小麦条锈菌 CDK5 基因克隆 生物信息学分析 

摘      要：为探究细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependentkinase5,CDK5)在小麦条锈菌(***)新菌系CYR34夏孢子萌发过程的毒性作用,以天水地区小麦条锈菌新菌系CYR34夏孢子标样为试材,通过RACE克隆CDK5基因并对其进行生物信息学分析,获得长度为706bp,编码190个氨基酸的cDNA序列。蛋白质结构预测显示,其二级结构主要以α-螺旋为主,且具有典型的STKC激酶结构域。同源性分析显示,CDK5与小麦杆锈菌(***)中的CDK5亲缘关系较近。蛋白质互作数据库预测分析发现,CDK5可以与磷酸核酮糖3-差异构酶、荚膜生物合成蛋白、鸟苷酸激酶、丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶、16SrRNA蛋白以及肌苷-5 -单磷酸脱氢酶6个蛋白互作关系;基因时序表达发现在孢子萌发0~6h时,基因的表达量持续下调,6h后表现为上调,萌发10h后为对照的1.2倍,萌发14h后基因的表达量达趋于平台期,为对照的1.36倍。综上所述,推测细胞周期蛋白依赖性激酶CDK5在小麦条锈菌(CYR34)夏孢子萌发过程中参与了适应环境的信号调控。