济南市新确证HIV-1型感染者的分子传播网络特征分析
Analysis of molecular transmission network characteristics of newly con-firmed HIV-1 infection in Jinan作者机构:济南市疾病预防控制中心 山东省疾病预防控制中心
出 版 物:《现代预防医学》 (Modern Preventive Medicine)
年 卷 期:2024年第51卷第1期
页 面:143-148页
学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学]
主 题:艾滋病 人类免疫缺陷病毒1型 分子传播网络 分子簇 耐药
摘 要:目的 分析济南市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1, HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征,为疫情流行趋势和防治提供依据。方法 收集济南市2021年新报告的感染HIV-1的血液样本168份,通过巢式PCR扩增HIV-1的pol区基因,采用neighbor-joining方法构建进化树,基因距离1.5%构建分子网络,对网络的相关因素进行分析。通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点。结果 168份样本序列共9个亚型,优势亚型主要为两个流行重组型(circulating recombinant form, CRF),CRF01_AE亚型(41.7%,70/168)和CRF07_BC亚型(36.3%,61/168),其他亚型有B、CRF68_01B、CRF55_01B、CRF65_CPX、CRF67_01B、CRF96_CPX及C亚型。在基因距离为1.50%时,共形成了15个分子簇,入网序列共51条,入网率为30.4%。7份样本存在监测性耐药突变(surveillance drug-resistance mutations, SDRM),耐药传播率为4.2%,集中为核苷类反转录酶抑制剂和非核苷类反转录酶抑制剂耐药位点突变。结论 济南市HIV-1亚型丰富,主要为CRF01_AE和CRF07_BC亚型。应构建分子传播网络对济南市进行长期监测,以采取针对性的措施阻断其传播。