基于生物信息学分析和实验验证的肥胖相关蛋白促进肾小球系膜细胞自噬和抑制炎症反应的机制研究
Study on the mechanism of fat mass and obesity associated proteins in promoting autophagy and inhibiting inflammatory response in glomerular mesangial cells based on bioinformatics analysis and experimental verification作者机构:安徽医科大学附属巢湖医院药剂科安徽巢湖238000
出 版 物:《中国医院药学杂志》 (Chinese Journal of Hospital Pharmacy)
年 卷 期:2024年第44卷第2期
页 面:138-145页
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学]
基 金:安徽省高等学校科学研究项目自然科学类重点项目(编号:2022AH050747)
主 题:肥胖相关蛋白 肾小球系膜细胞 细胞自噬 炎症 生物信息学
摘 要:目的:运用生物信息学方法和实验验证研究肥胖相关蛋白(fat mass and obesity associated proteins,FTO)促进肾小球系膜细胞自噬,抑制炎症反应的机制。方法:免疫组化分析FTO在慢性肾小球肾炎患者肾组织中的表达;透射电镜观察过表达FTO对肾小球系膜细胞自噬的影响,Western blot检测自噬标志蛋白;荧光双标观察过表达FTO对炎症反应的影响,ELISA法检测细胞上清IL-6和TNF-α表达水平。运用catRAPID omics v2.0和Encori数据库的预测FTO相关的互作基因,并进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。Western blot检测相关信号通路中的关键蛋白。构建PPI网络筛选核心蛋白。结果:免疫组化结果提示FTO在慢性肾小球肾炎患者肾脏组织表达显著降低(P0.01);过表达FTO可促进肾小球系膜细胞自噬,抑制炎症反应;通过Encori数据库和catRAPID omics v2.0数据库共得到737个FTO相关互作基因。KEGG分析结果提示Hippo信号通路、Wnt信号通路和Rap1信号通路被显著富集。Western blot实验表明过表达FTO可激活Hippo信号通路,抑制Wnt信号通路和Rap1信号通路。PPI调控网络筛选出16个核心基因。结论:FTO通过调控Hippo信号通路,Wnt信号通路,Rap1信号通路和AMPK信号通路等促进肾小球系膜细胞自噬和抑制炎症反应。CTNNB1、CTNND1、PPP2CA、YES1和ABL1等是FTO核心基因。