基于高通量测序对中国南北方地区学龄前健康儿童肠道菌群的横断面调查

作     者：董文迪 金霞霞 莫珊 姜美琳 刘艳欢 DONG Wendi;JIN Xiaxia;MO Shan;JIANG Meilin;LIU Yanhuan

作者机构：广州中医药大学佛山临床医学院佛山528000 中国中医科学院中药资源中心道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室北京100700 佛山复星禅诚医院佛山528000 

出 版 物：《中国循证儿科杂志》 (Chinese Journal of Evidence Based Pediatrics)

年 卷 期：2023年第18卷第6期

页      面：452-455页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

基　　金：佛山市莫珊名中医传承工作室建设项目:佛卫函92号 佛山市“十四五”中医特色专科项目:佛卫函15号 佛山市中医药骨干人才培养对象项目:佛卫函222号 

主　　题：肠道菌群 地域 学龄前儿童 

摘      要：背景肠道微生物群可通过多种途径影响人类的健康并与疾病的发生有关,不同地区人群中的肠道微生物构成差异明显。目的通过16S rRNA基因测序方法比较中国南北方地区学龄前健康儿童肠道微生物构成的差异。设计横断面调查。方法选择3~7岁学龄前健康儿童,南方组为广东省佛山市佛山复星禅诚医院体检中心体检儿童,北方组为新疆维吾尔自治区塔城地区某幼儿园在园儿童。由经过培训的家长采集儿童的粪便样本,由杭州谷禾信息技术有限公司完成肠道菌群检测及相关数据分析。主要结局指标菌群多样性,物种组成结构差异。结果2023年2月1日至2023年4月1日南方组纳入45名,年龄(4.0±1.5)岁;北方组纳入43名,年龄(4.1±1.3)岁;两组的性别构成、年龄、民族构成差异均无统计学意义。北方组Shannon、Simpson、Chao、ACE指数均高于南方组,差异均有统计学意义。PCoA图显示加权后观察到两组样本显著分离。北方组厚壁菌门的丰度高于南方组(55.1%vs 39.2%)、南方组变形菌门的丰度高于北方组(18.6%vs 7.2%)、南方组大肠埃氏菌属-志贺氏菌属的丰度高于北方组(11.8%vs 2.2%)、北方组粪杆菌属的丰度高于南方组(13.9%vs 6.3%),差异均有统计学意义。通过LEfSe分析及随机森林组间预测,在南方组找到大肠埃氏菌属-志贺氏菌属和活泼瘤胃球菌属2个差异有统计学意义的生物标志物,北方组找到粪杆菌属、琼脂杆菌属、毛螺菌属、塞内加尔厌氧菌属、罕见小球菌属、挑剔真杆菌属、副萨特氏菌属、小类杆菌属、罗氏菌属9个差异有统计学意义的生物标志物。结论中国南北方学龄前儿童肠道菌群存在显著差异,在未来进行肠道菌群与疾病的研究时,须充分考虑宿主的地域性。