紫外交联免疫沉淀技术原理及其应用

作     者：杜亚琼 王琬瑶 高帆 徐旸 时文涛 WANG Wan-Yao;GAO Fan;XU Yang;SHI Wen-Tao

作者机构：天津医科大学基础医学院遗传学系天津300070 南开大学医学院天津300071 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2024年第51卷第1期

页      面：136-144页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 

基　　金：国家自然科学基金(32170649 81802091)资助项目 

主　　题：紫外交联免疫沉淀 高通量测序 RNA结合蛋白 

摘      要：紫外交联免疫沉淀(UV cross-linking immunoprecipitation,CLIP)技术最初建立于2003年。通过紫外交联、免疫沉淀、逆转录及后续的高通量测序等步骤,可在全转录组范围鉴定特定RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)的靶标RNA序列和结合位点。在近20年的应用过程中,该技术被不断改进和完善,可操作性、实验结果的准确性都有所提升,技术的应用范围也有所拓展。本文对CLIP技术的基本原理、实验方法、实际应用进行介绍,着重比较几种主流CLIP技术的异同,并对如何选择具体的技术路线提出建议。