一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术

作     者：林旻 杨绍华 林艳 王月 胡太蛟 宋亚娜 潘雷博 陈在杰 LIN Min;YANG Shao-hua;LIN Yan;WANG Yue;HU Tai-jiao;SONG Ya-na;PAN Lei-bo;CHEN Zai-jie

作者机构：福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室福建福州350003 福建农林大学生命科学学院福建福州350002 

出 版 物：《福建农业科技》 (Fujian Agricultural Science and Technology)

年 卷 期：2023年第54卷第10期

页      面：40-47页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：福建省科技计划公益类项目(2020R1027009) 福建省人民政府、中国农业科学院“5511”协同创新工程(XTCXGC2021002) 

主　　题：水稻种子切片 96孔板结合磁珠法 高通量基因分型 STARP技术 

摘      要：建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA的质量。结果表明:96孔板结合磁珠法提取水稻种子切片的DNA质量和纯度优于TPS法提取水稻叶片的DNA质量;STARP标记检测验证结果显示96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA可适用于GS3、Wx的STARP标记基因分型,其鉴定结果与测序结果一致。研究显示96孔板结合磁珠法可以从微量水稻种子切片中提出高回收率、高纯度、高完整度、无PCR抑制物的DNA用于高通量STATP法基因单倍型分析,可获得一种96孔板结合磁珠法提取DNA的高通量基因分型操作流程。