基于高通量测序分析不同地区魔芋根际土壤细菌群落多样性

作     者：雷高 李珊珊 李亮亮 王佰涛 杨文玲 刘德海 LEI Gao;LI Shanshan;LI Liangliang;WANG Baitao;YANG Wenling;LIU Dehai

作者机构：河南省科学院生物研究所河南郑州450008 河南省微生物工程重点实验室河南郑州450008 

出 版 物：《中国酿造》 (China Brewing)

年 卷 期：2023年第42卷第11期

页      面：99-103页

学科分类：0832[工学-食品科学与工程（可授工学、农学学位）] 08[工学] 0836[工学-生物工程] 082203[工学-发酵工程] 0822[工学-轻工技术与工程] 083203[工学-农产品加工及贮藏工程] 

基　　金：中原科技创新领军人才计划资助项目(214200510011) 河南省科技攻关项目(222102110101) 

主　　题：高通量测序技术 魔芋 根际土壤 细菌 群落结构 

摘      要：以昆明、宁德、南阳3地区魔芋种植区域土壤为研究对象,使用Illumina MiSeq高通量测序技术,对细菌16S rRNA的V3~V4可变区进行测序,探究魔芋不同地区魔芋根际土壤中细菌群落结构和多样性的差异。结果表明,3处魔芋根际土壤样品共得到383726条有效序列,昆明、宁德、南阳样品分别得到2452种、2798种、2906种操作分类单元(OTUs)。Chao1指数、Ace指数、Shannon指数分析结果显示,3处土壤样品中细菌物种丰富度和多样性存在显著差异(P0.05)。在属水平上,3地区魔芋根际土壤中细菌种类存在差异。昆明土壤样品中优势菌属(相对丰度≥1%)有12个,其中热酸菌属(Acidothermus)和芽单胞菌属(Gemmatimonas)为其独有;宁德土壤样品中优势菌属有7个,其中微杆菌属(Microbacterium)为其特有;南阳土壤样品中优势菌属有8个,芽孢杆菌属(Bacillus)为其独有。表明不同地区魔芋根际土壤细菌优势菌属存在明显不同。