6株超级细菌NDM-1基因环境研究
作者机构:南方医科大学南方医院检验科广州市510515
出 版 物:《实用医学杂志》 (The Journal of Practical Medicine)
年 卷 期:2014年第30卷第11期
页 面:1820-1823页
学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学]
基 金:广东省自然科学基金项目(编号:S2012010009153)
摘 要:目的:研究6株超级细菌NDM-1基因环境,探讨耐药基因水平转移机制。方法:收集耐碳青霉烯的G-杆菌400株,利用PCR方法检测NDM-1基因,并测序验证。根据目前报道的NDM-1基因环境常见类型设计系列引物,步移法特异性扩增NDM-1基因上下游序列,并对扩增产物测序和序列分析。步移法检测阴性的菌株进行全基因组HindⅢ酶切,将NDM-1基因及基因环境克隆到pET28a质粒后再测序。结果:400株对碳青霉烯类耐药的G-杆菌中有6株NDM-1阳性。步移法检出其中5株菌的基因环境,包括不动杆菌基因种13TU、产酸克雷伯菌、不动杆菌基因种3、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌。这5株菌的基因环境与文献报道基本一致。产气肠杆菌的NDM-1基因环境经DNA克隆测序获得,从上游至下游为:部分缺失的转座酶Tn3、IS26及ISAba125,blaNDM-1,ble,部分缺失的异构酶trpF和SSen4元件。结论:NDM-1基因上下游常包含转座子或插入序列等元件,为其水平转移奠定基础。