基于TMT蛋白组学探讨消肿止痛合剂治疗皮瓣缺血再灌注损伤的作用机制

作     者：马岁录 何志军 刘涛 李岩 何元旭 何波 Ma Suilu;He Zhijun;Liu Tao;Li Yan;He Yuanxu;He Bo

作者机构：甘肃中医药大学中医临床学院兰州730030 甘肃省中医院兰州730050 

出 版 物：《世界科学技术(中医药现代化)》 (Modernization of Traditional Chinese Medicine and Materia Medica-World Science and Technology)

年 卷 期：2023年第25卷第6期

页      面：1987-1997页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：甘肃省中医药管理局项目重点课题(GZKZ-2020-2):基于多组学及网络药理学研究消肿止痛合剂治疗皮瓣缺血再灌注损伤的作用机制,负责人:何志军 国家自然科学基金委员会面上项目(81660802):消肿止痛合剂对皮瓣修复后血管再生及其信号通路VEGF-Dll4/Notch的机制研究,负责人:何志军 兰州市人才创新创业专项(2019-RC-63):消肿止痛合剂工艺质量提升及药效学研究,负责人:何志军 

主　　题：消肿止痛合剂 TMT蛋白组学 皮瓣缺血再灌注 生物信息学分析 

摘      要：目的应用Tandem Mass Tag(TMT)体外定量蛋白组学技术研究消肿止痛合剂治疗大鼠皮瓣缺血再灌注损伤(Flap Ischemia-reperfusion Injury,FIRI)的作用机制。方法30只SD大鼠随机分为正常组、模型组、消肿止痛合剂组(消肿组),每组10只;正常组腹腔麻醉后切开背部约5 cm*6 cm皮肤及其皮下筋膜,未游离皮瓣,模型组与消肿组腹腔麻醉后完全游离背部大小约5 cm×6 cm带蒂皮瓣,模拟FIRI;消肿组给予消肿止痛合剂灌胃(1.8 mL·kg^(-1)),每天1次,正常组和模型组给予生理盐水灌胃(1.8 mL·kg^(-1)),每天1次,3组大鼠连续灌胃7天;7天后取大鼠背部皮瓣组织进行TMT蛋白组学分析,筛选出差异蛋白,对其进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析、通路富集(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析、共同差异蛋白分析,并建立差异蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络分析。结果本次实验通过蛋白质定量共筛选出5005个蛋白质,其中鉴别到4996个蛋白质,筛选出消肿组/模型组之间141个上调和132个下调的差异表达蛋白。GO富集分析发现差异表达蛋白主要参与有机体细胞代谢、细胞组分的发生与结合、分解代谢、细胞器形成、线粒体形成、细胞内物质催化、分子结合、水解酶活化、核苷酸调节等分子机制。KEGG通路分析发现差异表达蛋白主要涉及有机体细胞代谢、核糖体转录翻译、蛋白酶体系统、细胞周期等信号通路。PPI分析发现共同表达差异蛋白Mrpl32、Psma2、Mrpl34、Psma4、Psmb1、Srp9位于相互作用网络的关键节点。结论消肿止痛合剂治疗大鼠FIRI可能与线粒体核糖体相关信号通路、20S蛋白酶体系统信号通路等有关,其中差异蛋白Mrpl32、Psma2、Mrpl34、Psma4、Psmb1可能是药物发挥作用的关键靶点。