山西省2018-2020年猪圆环病毒3型的检测及Cap基因遗传演化分析

作     者：孟帆 薛翼鹏 赵岳 米瑞娟 吴忻 MENG Fan;XUE Yipeng;ZHAO Yue;MI Ruijuan;WU Xin

作者机构：山西农业大学动物医学学院山西太谷0030801 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2023年第43卷第9期

页      面：1793-1799页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：中央引导地方科技发展资金资助项目(YDZJSX2022C023) 山西省重点研发计划资助项目(201903D221005) 山西省重点研发计划资助项目(201803D221026-1) 国家自然科学基金资助项目(32172904) 

主　　题：猪圆环病毒3型 ORF2基因 遗传变异分析 

摘      要：为了掌握近年来山西省猪圆环病毒3型(PCV3)的分子流行病学情况,运用PCR技术对2018-2020年在山西省猪场采集的1125份血清和病、死猪组织样品进行PCV3检测,然后对获得的5份PCV3阳性样品ORF2序列进行测序,并对ORF2序列和推导出的Cap蛋白氨基酸序列进行遗传进化分析。结果发现,PCV3在山西省猪场感染严重,山西省2018-2020年PCV3平均阳性率为21.42%,猪场平均阳性率为44.17%,且猪场PCV3型的平均阳性率有呈逐年上升的趋势;测序发现山西省5株PCV3的ORF2核酸序列均为645bp,编码214个氨基酸,5株PCV3 ORF2之间核苷酸和Cap蛋白氨基酸同源性分别为99.2%~100.0%和98.1%~100.0%,与36株参考株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为98.1%~99.8%和97.2%~100.0%;PCV3的ORF2核酸序列遗传进化分析表明,山西省5株PCV3流行株都属于PCV3b亚型,由此可见目前山西省PCV3流行株主要为PCV3b亚型。5株PCV3Cap蛋白氨基酸序列较为保守,没有出现不同于其他毒株的特异性突变。本研究结果为了解PCV3在山西省的流行和遗传进化特点提供了理论依据,也为山西省PCV3的科学防控奠定了基础。