微泡菌属菌株YPW1和YPW16多糖降解特性分析

作     者：田春苗 龙思琪 王健鑫 汪江琦 王定全 周圣凯 朱尚宁 曲武 TIAN Chunmiao;LONG Siqi;WANG Jianxin;WANG Jiangqi;WANG Dingquan;ZHOU Shengkai;ZHU Shangning;QU Wu

作者机构：浙江海洋大学比萨海洋研究生学院浙江舟山316022 浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江舟山316022 温州市沙城高级中学浙江温州325000 无锡药明生物技术股份有限公司浙江杭州310000 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2023年第50卷第9期

页      面：3747-3770页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基　　金：浙江省“尖兵”“领雁”研发攻关计划(2022C02040) 浙江省自然科学基金(LQ22D060004) 浙江省教育厅一般科研项目(Y202147737) 舟山市科技局项目(2022C13048) 大学生创新创业训练项目(202210340013) 

主　　题：微泡菌属 多糖降解 最适条件 基因组 

摘      要：【背景】海洋环境中分离到的微泡菌属菌株具有多糖降解能力,在环境中可以作为糖类代谢的重要执行者参与海洋碳循环过程。【目的】测定2株微泡菌属菌株的多糖降解活性,通过与微泡菌属其他菌株基因组比较分析2株菌的多糖降解基因特征。【方法】通过3,5-dinitrosalicylic acid(DNS)定糖法测定多糖降解活性,同时利用高通量测序技术对菌株基因组序列进行测定与组装,并与其他基因组注释结果进行比较分析。【结果】分离得到2株微泡菌属菌株YPW1和YPW16,二者均为潜在新种。结果表明,菌株YPW1能够降解琼胶、褐藻胶、果胶、几丁质、木聚糖、淀粉、普鲁兰等7种多糖,而菌株YPW16仅可降解淀粉和普鲁兰。基因组分析表明,YPW1具有上述7种多糖的降解酶基因,但菌株YPW16只具有淀粉酶与普鲁兰酶降解基因。相较于其他微泡菌属菌株,菌株YPW1多糖降解范围、多糖降解酶基因种类与丰度较高,但菌株YPW16多糖降解范围却较为狭窄。由此可知,多糖降解酶基因在微泡菌属基因组中的分布差异性较大。【结论】本研究为微泡菌属提供了2株潜在的新型菌株资源,为生物多糖降解提供了生化工具,也为研究微泡菌属菌株中多糖降解基因分布与相关菌属的生态功能奠定基础。