全基因组关联分析鉴定太行鸡产蛋性状功能基因

作     者：朱迪 谢艳华 王宇哲 刘华格 褚素欣 褚素乔 

作者机构：中国农业大学生物学院北京100193 石家庄市牧工商开发总公司河北石家庄050057 中国农业大学模式动物表型与遗传重大设施北京100193 河北省兽药饲料工作总站河北石家庄050035 石家庄市农业综合执法支队河北石家庄050800 石家庄市畜牧技术推广站河北石家庄050031 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2023年第59卷第9期

页      面：224-230页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家重点研发计划(2021YFD1300100) 河北省现代农业产业技术体系蛋鸡肉鸡创新团队建设项目(HBCT2018150403) 河北省科技厅重点研发计划项目(20326352D) 

主　　题：太行鸡 产蛋性状 低深度重测序 全基因组关联分析 

摘      要：鸡蛋是人类重要的蛋白质来源,产蛋性状是鸡重要的经济性状,鉴定鸡产蛋性状相关的重要功能位点对于蛋鸡育种意义重大。本研究采集了1 100只太行鸡样本,记录其产蛋数和开产日龄2个表型,使用目前在农业动物中广泛应用的低深度重测序技术对全部样本进行基因分型。本研究共鉴定到覆盖全基因组的680万个单核苷酸多态性位点。针对产蛋数性状和开产日龄性状分别进行方差组分估计和全基因组关联分析,遗传力估计结果显示2个性状的遗传力均较低,其中开产日龄估计遗传力为0.155,产蛋数估计遗传力为0.102。在全基因组关联分析中发现了影响开产日龄的4个候选主效基因CPD、ENSGALG00000007646、ENSGALG00000007656和CDX4,以及16个SNP标记。通过功能富集分析鉴定到了细胞黏附和细胞膜相关通路、质膜钙信号通路以及磷脂酰肌醇信号通路等在产蛋数性状中发挥的重要作用。本研究为太行鸡产蛋相关性状选育提供了重要的分子标记,为下一步的保种育种工作奠定了基础。