两株临床分离的金黄杆菌的鉴定和系统发育分析

作     者：吴映琳 郑德想 李刚 李启伟 张轩 蓝锴 刘尹臻 夏海宁 贾伟 曾建明 陈茶 黄彬 Wu Yinglin;Zheng Dexiang;Li Gang;Li Qiwei;Zhang Xuan;Lan Kai;Liu Yinzhen;Xia Haining;Jia Wei;Zeng Jianming;Chen Cha;Huang Bin

作者机构：广州中医药大学第二临床医学院广州510006 广州中医药大学第二临床医学院/广东省中医院检验医学部广州510006 宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏750003 中山大学附属第一医院检验医学部广州510062 

出 版 物：《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期：2023年第43卷第8期

页      面：589-596页

核心收录：

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

主　　题：金黄杆菌 16S rRNA 全基因组测序 系统发育树 

摘      要：目的:对临床痰液和中段尿标本分离的SQ219和SQ220进行生物学特性、系统进化和临床意义分析。方法:观察菌株的培养特性及生理生化特征;用VITEK2全自动微生物鉴定和药敏分析仪及MALDI-TOF质谱仪鉴定细菌;利用相关软件对细菌16S rRNA和核心基因组作系统发育分析及基因组平均核苷酸一致性(ANI)分析。结果:SQ219和SQ220为革兰阴性杆菌,专性需氧,触酶和氧化酶阳性,无动力;在30℃、pH7和不含NaCl的培养基中生长最佳;SQ220可在血平板上产生黄色素但SQ219不产生;SQ219和SQ220对氨曲南、阿米卡星、妥布霉素、黏菌素耐药,与金黄杆菌属药敏表型一致。SQ219和SQ220总长分别为5.08 Mb和4.80 Mb,G+C含量分别为36.72%和36.36%,均预测到β-内酰胺类耐药基因( blaCGA)。16S rRNA系统发育分析表明SQ219、SQ220与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T相似性最高,分别为98.93%和98.36%;核心基因组进化分析显示SQ219、SQ220与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T的进化关系最近。然而,两株菌与啤酒神金黄杆菌DSM18014 T ANI值分别为92.49%和93.27%,低于95%原核生物种的阈值。 结论:根据16S rRNA和全基因组的同源性和系统发育分析,判断SQ219和SQ220为金黄杆菌新种,丰富了金黄杆菌的进化信息,为金黄杆菌属细菌新种的鉴定奠定了基础。