联合多组学数据鉴定猪脂肪沉积的候选基因

作     者：刘华涛 马福平 赵卿尧 杨金艳 汪佳豪 王露露 丁向东 王楚端 

作者机构：中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室动物育种国家工程实验室北京100193 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2023年第59卷第8期

页      面：123-130页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系 国家重点研发计划项目(2019YFE0106800) 

主　　题：大白猪 脂肪沉积 eQTL分析 GWAS 共定位分析 

摘      要：脂肪沉积是猪生产及育种中最为重要的经济性状指标之一,其调控机制一直是研究热点,单一组学的研究方法不足以推测与还原出猪脂肪沉积复杂的调控过程。因此本研究联合多组学数据共同进行分析以鉴定猪脂肪沉积的候选基因。首先对同一猪场相同日龄和体重的461头大白猪进行基因分型,并将芯片数据填充至测序水平,然后对其中132个个体进行背最长肌mRNA测序,根据基因表达水平和包含15389322个SNP的测序数据进行eQTL分析鉴定到33756个cis-eQTL,且多为正向调控。之后基于猪的背膘厚度表型利用测序数据进行GWAS确定了312个显著SNP。最后通过GWAS与eQTL的共定位分析定位到一个显著信号位点SSC9:15828911,对应的调控基因为RAB30,且有研究表明其会参与脂肪的合成和代谢,可以作为影响猪脂肪沉积的候选基因。研究结果为猪脂肪沉积的遗传解析和猪肉质改良的分子育种提供理论依据和重要参考。