鸡Myf5蛋白结构与功能的生物信息学分析

作     者：张珂 于欣淼 彭星瑞 ZHANG Ke;YU Xin-miao;PENG Xing-rui

作者机构：沈阳大学生命科学与工程学院辽宁沈阳110044 

出 版 物：《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)

年 卷 期：2023年第51卷第15期

页      面：93-96,103页

学科分类：08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：辽宁省博士科研启动基金计划项目(2019-BS-171) 

主　　题：鸡 成肌因子5 生物信息学分析 

摘      要：[目的]分析并预测鸡Myf5蛋白的结构与生物学功能。[方法]采用ProtParam、ProtScale、SingnalP-4.1、STRING等软件对鸡Myf5蛋白的序列结构及互作蛋白进行分析。[结果]该蛋白由258个氨基酸构成,分子式为C_(1221)H_(1915)N_(359)O_(391)S_(18),氨基酸残基中带负电荷的(Asp+Glu)共有34个,氨基酸残基中带正电荷的(Arg+Lys)共有29个;理论等电点(pI)为5.86,半衰期为30 h,不稳定性指数为97.59(40);亲水性平均值(GRAVY)为-0.701,脂溶指数为54.92;其二级结构主要以无规则卷曲为主,占比63.57%,其次为α-螺旋,占比29.84%;该蛋白定位于细胞核中,不具备跨膜性,共有74个潜在的磷酸化位点,无信号肽,为亲水性不稳定蛋白。蛋白互作分析结果显示,鸡Myf5关联的蛋白有PAX7、PAX3、SOX10、MYOD1、MYOG和SDC4,进化分析结果显示不同物种间该蛋白序列具有较高的保守性。[结论]该蛋白可能在鸡肌肉的生长发育过程中发挥重要作用,为进一步探索其功能奠定基础。