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基于DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶的物种鉴定

Species identification of common Sciaenidae fish maw based on DNA barcoding

作     者:叶晓康 李艳芬 董慧 王树启 温小波 林帆 YE Xiao-Kang;LI Yan-Fen;DONG Hui;WANG Shu-Qi;WEN Xiao-Bo;LIN Fan

作者机构:汕头大学海洋科学研究院广东省海洋生物技术重点实验室汕头515063 汕头市鱼胶海味协会汕头515063 汕头市颐膳美食品有限公司汕头515031 华南农业大学海洋学院广州510642 

出 版 物:《食品安全质量检测学报》 (Journal of Food Safety and Quality)

年 卷 期:2023年第14卷第14期

页      面:236-244页

学科分类:0832[工学-食品科学与工程(可授工学、农学学位)] 08[工学] 083204[工学-水产品加工及贮藏工程] 

基  金:广东省自然科学基金项目(2022A1515010778) 广东省科技专项(STKJ2021099) 

主  题:鱼胶 DNA条形码 COI基因 物种鉴定 石首鱼科 

摘      要:目的运用DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶进行物种鉴定。方法通过对26份鱼胶样品基因组DNA提取,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增细胞色素C氧化酶Ⅰ(cytochrome c oxidase,COI)基因、测序,用生命条形码数据(barcode of life data,BOLD)物种鉴定系统,与数据库中已有鱼类序列进行比对分析,鉴定出各鱼胶的物种;根据Kimura双参数模型计算样品序列遗传距离,并将所得序列使用邻接法(neighbor-joining,NJ)和最大简约法(maximum parsimony,MP)构建系统发育树,进行聚类分析。结果26份鱼胶样品通过鉴定引物“Fish-F“Fish-R均可实现扩增,条带清晰,扩增和测序成功率均为100%;BOLD鉴定结果显示,26份鱼胶样品中23份能够确定物种来源(相似性达98%以上),包括石首鱼科12属15种鱼类,且多数为外来物种,另外3份鱼胶可推测其近缘物种。此外,系统发育树聚类分析结果与物种鉴定结果一致。结论目前石首鱼类鱼胶来源物种较多,且多为外来基原鱼种。DNA条形码技术与BOLD鉴定系统相结合,可对大部分鱼胶进行准确的物种鉴定。

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