靶向测序技术检测成人型胶质瘤多靶点拷贝数变异的研究

作     者：郑淑荣 刘玉清 柴睿超 Zheng Shurong;Liu Yuqing;Chai Ruichao

作者机构：首都医科大学北京市神经外科研究所北京100070 

出 版 物：《中华神经外科杂志》 (Chinese Journal of Neurosurgery)

年 卷 期：2023年第39卷第5期

页      面：500-505页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(82003193) 北京市科技新星计划(Z201100006820118)。 

主　　题：神经胶质瘤 DNA拷贝数变异 高通量核苷酸序列分析 病理学 分子 诊断 

摘      要：目的 建立一种成人型胶质瘤临床样本多靶点(1号、19号、7号、10号染色体,EGFR、CDKN2A/B基因)拷贝数变异并行的检测方法.方法 基于二代测序技术建立拷贝数靶向测序方法,采用5个经全外显子测序已明确拷贝数变异信息的临床样本为标准样本,通过检测1号、19号、7号、10号染色体,EGFR、CDKN2A/B基因拷贝数的多种变异情况,评估拷贝数靶向测序方法的准确性;通过原位荧光杂交方法评估这一检测方法对CDKN2A/B基因杂合性和纯合性缺失的鉴别能力;通过回顾性收集中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库中的77例临床样本,对这一方法的临床实用性进行评估.结果 所建立的拷贝数靶向测序方法可以准确检测出5个标准样本中1号、19号、7号、10号染色体,EGFR、CDKN2A/B基因拷贝数的变异情况.通过与原位荧光杂交检测结果进行比对,发现拷贝数靶向测序方法可准确鉴别CDKN2A/B基因的纯合性缺失和杂合性缺失.针对CGGA数据库中临床样本的检测结果显示,采用拷贝数靶向测序方法可完成对77例临床样本的1号、19号、7号、10号染色体,EGFR、CDKN2A/B基因的检测需求,根据检测结果可将77例样本按照2021版世界卫生组织中枢神经系统肿瘤分类方法进行精准分类和分级.结论 基于二代测序技术建立的拷贝数靶向测序方法可以同时检测胶质瘤样本多靶点(1号、19号、7号、10号染色体,EGFR、CDKN2A/B基因)拷贝数的变异,适合作为临床分子病理学常规检测技术.