2021年湖南省人民医院新生儿副肠孤病毒的遗传进化分析

作     者：马晓华 谢乐云 柴萨萨 高升辉 张爱民 余阗 郑贵森 李利利 曾赛珍 段招军 Ma Xiaohua;Xie Leyun;Chai Sasa;Gao Shenghui;Zhang Aimin;Yu Tian;Zheng Guisen;Li Lili;Zeng Saizhen;Duan Zhaojun

作者机构：甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京100052 湖南省人民医院湖南师范大学附属第一医院长沙410005 华北理工大学基础医学院唐山063000 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2023年第37卷第2期

页      面：184-188页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

主　　题：新生儿 副肠孤病毒 遗传进化分析 

摘      要：目的初步了解湖南省人民医院新生儿中副肠孤病毒的流行情况,分析其遗传进化特征。方法2021年6~9月份在湖南省人民医院采集住院新生儿粪便标本,采用TaqMan real-time qPCR和RT-PCR方法进行人副肠孤病毒(human parechovirus,HPeV)的筛查和分型,采用高通量测序和RT-PCR方法扩增其全基因组,序列测定后进行系统发育分析。结果共采集新生儿粪便样本123份,其中HPeV阳性为22份,阳性率为17.89%,分型结果显示所有毒株均属于HPeV-1基因型;扩增获得1株HPeV基因组全长为7269 bp,命名为Hunan/HPeV/2021,该基因组具有典型的HPeV基因组结构;序列比对结果显示该毒株与GenBank中已知的HPeV-1型的基因组核苷酸序列具有最高同源性,为86.6%~91.9%;其编码的唯一的长开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为6540 nt,与已知相似序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.3%~92.6%和97.3%~98.3%;系统发育分析显示该病毒株属于HPeV-1型进化分支,与我国流行的HPeV-1型毒株聚为同一分支。结论在湖南省人民医院新生儿中HPeV具有较高的检出率且均为HPeV-1型。