靶向高通量测序鉴定非结核分枝杆菌菌种的应用价值

作     者：陈华 陈品儒 李艳阳 邓政先 许柳清 梁锋 胡锦兴 Chen Hua;Chen Pinru;Li Yanyang;Deng Zhengxian;Xu Liuqing;Liang Feng;Hu Jinxing

作者机构：广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心/呼吸疾病国家重点实验室广州510095 

出 版 物：《中国防痨杂志》 (Chinese Journal of Antituberculosis)

年 卷 期：2023年第45卷第4期

页      面：362-366页

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 100705[医学-微生物与生化药学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：广东省医学科学技术研究基金(C2021090) 

主　　题：分子序列数据 分枝杆菌属 诊断,鉴别 

摘      要：目的:探讨靶向高通量测序(targeted next-generation sequencing,tNGS)技术在非结核分枝杆菌菌种鉴定的应用价值。方法:收集2021年7月至2022年9月,在广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心住院患者的428份标本进行研究,其中,痰标本312份,支气管肺泡灌洗液标本116份。对上述标本进行tNGS分枝杆菌鉴定(简称“tNGS法)和微生物培养(BACTEC MGIT 960)+DNA微阵列芯片法(简称“培养法)进行分枝杆菌菌种鉴定,并对2种方法检测结果进行比较。结果:(1)tNGS法和培养法分别分离出结核分枝杆菌102份和56份,非结核分枝杆菌150份和182份。(2)tNGS法的分枝杆菌检出率为58.88%(252/428),与培养法阳性率55.61%(238/428)比较,差异无统计学意义(χ^(2)=0.936,P=0.333)。(3)以培养法为参照标准,tNGS法检测分枝杆菌的敏感度、特异度、假阴性率、假阳性率、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为80.65%(200/248)、92.22%(166/180)、22.43%(48/214)、6.54%(14/214)、93.46%(200/214)、77.57%(166/214)和0.710。结论:tNGS法与培养法一致性良好,具备很好的时效性、敏感度、特异度,利于早期制定临床治疗方案。