基于全长转录组测序挖掘中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)性腺发育相关基因

作     者：李鹏琛 刘炳正 苏唯一 常帅 金晗 常亚青 孙志惠 Li Pengchen;Liu Bingzheng;Su Weiyi;Chang Shuai;Jin Han;Chang Yaqing;Sun Zhihui

作者机构：大连海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室大连116023 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2022年第41卷第11期

页      面：2062-2075页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31802276) 辽宁省科技创新领军人才项目(XLYC2002107) 大连海洋大学大学生创新创业项目(A202110158006)共同资助 

主　　题：中间球海胆 转录组测序 性腺发育 性别决定 

摘      要：中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)是一个重要的海水养殖品种,性腺是其唯一可食用的部分。海胆产业季节性强,若能人工控制其性成熟将具有重要的经济价值。本研究对处于营养噬细胞(nutritive phagocyte,NP)恢复期的中间球海胆精巢及卵巢进行全长转录组测序,以期挖掘参与其性别决定、性别分化和配子发生相关的基因。通过从头组装(de novo)获得64949条Unigenes,通过同源比对分析共注释了23848个(36.72%)功能基因。通过比较精巢及卵巢中Unigenes的表达水平,获得了15985个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。与精巢相比,卵巢中8355个DEGs显著上调,7630个DEGs显著下调。利用GO聚类分析、差异基因表达分析等鉴定了14个精巢特异表达基因(DMRT1、Catspere、Meioc等),16个卵巢特异表达基因(TGFBI、EGF3、EGF1等)和19个进化上保守的性别相关基因(Spata4、DMC1、HSF5、gata4等)。本研究为解析中间球海胆性腺发育机制奠定了基础。