网络药理学联合GEO测序数据探讨荷叶抗肥胖的作用机制

作     者：马露 张雅楠 霍金海 王伟明 

作者机构：黑龙江省中医药科学院黑龙江哈尔滨150036 

出 版 物：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》 

年 卷 期：2023年第2期

页      面：0036-0039页

学科分类：1006[医学-中西医结合] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基　　金：国家中药材产业技术体系专项项目(CARS-21) 国家中医药管理局全国中药资源普查项目(GZY-KJS-2018-004)。 

主　　题：荷叶 网络药理学 肥胖症 GEO数据库 靶点预测 

摘      要：利用网络药理学联合GEO测序数据及分子对接的方法对荷叶抗肥胖症的作用机制进行研究。方法 运用Pub Chem、SwissTargetPrediction、DrugBank、PharmMapper、CTD及UniProt数据库筛选荷叶活性成分及其靶点;使用DisGeNET、OMIM、CTD等数据库获取肥胖症靶点;并对其成分靶点与疾病靶点取交集,使用Cytoscape3.8.0软件构建靶点蛋白互作网络;然后使用STRING数据库对关键靶点蛋白进行GEO基因表达分析,同时使用DAVID数据库对靶点基因进行GO富集和KEGG通路分析,对剩余靶点用Cytoscape3.8.0软件绘制成分-靶点-通路网络;并使用AutoDockTools1.5.6软件对核心靶点与活性成分进行分子对接。结果 KEGG通路富集分析显示,荷叶调节肥胖症可能与癌症中蛋白多糖信号通路、VEGF信号通路、HIF-1信号通路等19条通路有关。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚与MMP2、AKT1、HMOX1、HIF1A核心靶点蛋白结合能均≤-6.0kcal·mol?1。结论 荷叶调节肥胖症的作用机制是多成分、多靶点、多通路的一个复杂过程。