西藏扎布耶盐湖细菌多样性的免培养技术分析
Bacterial Diversity in Zabuye Salt Lake of Tibet by Culture-Independent Approaches作者机构:中国地质科学院矿产资源研究所北京100037 国土资源部盐湖资源与环境重点实验室北京100037 中国地质科学院盐湖与热水资源研究发展中心北京100037
出 版 物:《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)
年 卷 期:2010年第50卷第3期
页 面:334-341页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
基 金:国家自然基金项目(40772065 40572059)~~
主 题:扎布耶盐湖,细菌多样性,免培养技术 16S rRNA基因 ARDRA
摘 要:【目的】利用免培养技术,获得有关西藏高原高盐度、高海拔盐湖的细菌多样性认识。【方法】从西藏扎布耶盐湖沉积样品中提取微生物总DNA,利用细菌引物f530/r1492扩增16S rRNA基因,然后构建16S rRNA基因质粒文库。采用HaeⅢ和HhaⅠ两种内切酶对阳性克隆质粒DNA进行ARDRA分型分析,根据分型结果挑选克隆进行测序。得到它们的16SrRNA基因部分序列,根据获得的序列构建构建系统发育树。【结果】在系统发育树上,部分克隆(占总克隆数的57.14%)与已知细菌属归于同一分支,主要分布在γ-变形菌纲、α-变形菌纲、δ-变形菌纲、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)的23个嗜盐细菌属之中。其余的克隆为未培养序列,与前者差异很大,在进化树上形成了独立的分支。【结论】研究结果显示出扎布耶茶卡湖中的细菌组成具有极其丰富的多样性。