红花CDPK基因家族的鉴定及表达分析

作     者：胡祥祥 许姣 宋梦瑶 朱畇昊 Hu Xiangxiang

作者机构：河南中医药大学药学院河南郑州450046 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心河南郑州450046 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2023年第51卷第4期

页      面：39-46页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(编号:81603232) 国家重点研发计划(编号:2017YFC1702800) 河南省重大科技专项(编号:171100310500) 河南省科技攻关项目(编号:172102310539)。 

主　　题：红花 CDPK基因家族 生物信息学分析 表达分析 染色体定位 

摘      要：钙依赖性蛋白激酶(CDPK)是植物细胞内Ca2+信号识别及转导的重要媒介,在植物的生长发育以及逆境响应过程中起着重要的作用。本研究通过多种生物信息学的方法和手段,对鉴定出来的30个CDPK基因进行分析鉴定,结果显示30个CtCDPK基因所编码的氨基酸分子量为47781.96~93251.66 ku,等电点为5.09~9.27;基因结构预测结果表明,所有CtCDPK基因均含有6~13个外显子;染色体定位结果表明,30个CtCDPK基因分别定位在10条染色体上,其中8号染色体上最多,有5个,2号、4号染色体上没有;系统发育树分析结果显示将其分为6个亚家族;表达分析结果表明CtCDPK基因在不同组织、不同发育阶段中表达模式有所差异。