北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析

作     者：苏艳芳 杨曼 牛乃琪 侯欣华 张龙超 SU Yanfang;YANG Man;NIU Naiqi;HOU Xinhua;ZHANG Longchao

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2023年第54卷第3期

页      面：966-975页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2021YFD1301101) 国家生猪产业技术体系(CARS-35) 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202006-04)。 

主　　题：北京黑猪 FABP3 SCD 肉品质 关联分析 

摘      要：旨在研究脂肪酸结合蛋白-3(fatty acid binding protein 3,FABP3)和硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。本研究以413头北京黑猪为材料,收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3和SCD基因序列设计20对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件分析测序结果,对FABP3和SCD基因进行不同基因型与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。结果发现,FABP3基因存在1个错义突变(c.681AG),SCD基因存在1个错义突变、2个同义突变以及2个3′UTR区突变。使用Duncan’s多重检验统计分析发现,SCD基因内的SNPs与肉品质性状关联均不显著;FABP3基因错义突变位点c.681AG与肉色L*和IMF含量显著关联(PG两种纯合基因型(AA和GG)个体表达量差异分析,发现该突变位点两种纯合基因型个体间基因表达量差异不显著,说明FABP3 c.681AG错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量和肉色L*性状。上述两个基因中只有1个位点与肉色L*和IMF含量关联显著,可以作为北京黑猪肉品质性状的候选基因功能位点,也能为北京黑猪肉品质育种提供了新的分子标记。