内蒙古白绒山羊erk2基因的克隆及表达模式分析
Cloning and expression pattern of erk2 gene in Inner Mongolia Cashmere Goat作者机构:内蒙古大学生命科学学院内蒙古呼和浩特010021 赤峰市医院内蒙古赤峰024000
出 版 物:《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)
年 卷 期:2013年第29卷第12期
页 面:1743-1752页
核心收录:
基 金:国家自然科学基金(No.31160469) 内蒙古自然科学基金(No.2011MS0521)资助~~
摘 要:旨在克隆内蒙古白绒山羊erk2基因cDNA并分析其基本表达模式。采用RT-PCR方法克隆白绒山羊erk2基因cDNA。通过在线软件Blast进行核酸序列分析,用SMART与Psite进行氨基酸序列分析。定量RT-PCR检测erk2基因在绒山羊组织中的表达特异性。免疫组化法检测绒山羊睾丸中erk2表达。克隆到的内蒙古白绒山羊erk2基因cDNA片段(GenBank Accession ***569765)长1 083 bp,包含了编码360个氨基酸残基的全长ORF,氨基酸序列与牛的ERK2(Bos Taurus BC133588.1)同源性为100%。SMART分析表明,ORF编码的蛋白包含了活化位点TEY及具有丝氨酸/苏氨酸激酶催化活性的S-TKc结构域。Psite分析表明,含2个N-糖基化位点、1个依赖于cAMP/cGMP的蛋白激酶磷酸化位点、3个蛋白激酶c磷酸化位点、5个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、2个N-豆蔻酰化位点、2个异戊二烯基结合区(CAAX box)、7个微体羧基端靶向信号、2个蛋白激酶ATP结合区标记及一个丝/苏氨酸蛋白激酶活性区域标记。PSORT(k-NN prediction)程序预测其定位于细胞质中。定量RT-PCR分析显示erk2基因mRNA丰度在心脏、皮肤以及乳腺组织中mRNA丰度较高,脾、肾中的表达相对较低。在睾丸中检测到ERK2蛋白表达。