致倦库蚊Cecropin基因家族的比较和系统发育分析

作     者：赵文静 张晶 张春林 翟素珍 王吉平 Zhao Wenjing;Zhang Jing;Zhang Chunlin;Zhai Suzhen;Wang Jiping

作者机构：贵州医科大学基础医学院生物学教研室贵阳550004 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2016年第35卷第2期

页      面：294-301页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：贵州省科技厅黔科合LH字7363号 贵州省教育厅F2008-4号基金共同资助 

主　　题：致倦库蚊 Cecropin 基因家族 生物信息学 

摘      要：利用生物信息学方法比较分析了致倦库蚊Cecropin家族4成员的基因结构、氨基酸序列、蛋白理化特性,预测蛋白空间结构,并基于7种昆虫绘制分子进化树,随后使用RT-PCR方法获取致倦库蚊Cecropin家族4成员的c DNA。结果表明：致倦库蚊Cecropin家族基因有两条正向编码,两条反向编码,长度为330~544 bp,由2个外显子和1个内含子构成;氨基酸序列长度为59~61 aa,具有两条基序和多个保守位点;编码的蛋白理论分子量为6 284.6~6 619.0 k D,p I值为10.36~11.24,亲水性平均系数为0.393~0.551;蛋白预测的二级结构和三级结构结果基本一致,它们具有1个信号肽结构域和1个催化结构域,结构域主要由α-螺旋构成;7种昆虫的Cecropin蛋白进化关系与物种进化关系基本一致,并以“目或“亚目为单位分别聚类,CPIJ005108与致倦库蚊Cecropin祖先基因最相似。本研究的分析结果可为蚊科Cecropin结构和功能的研究提供有价值的信息。