北京黑猪FUBP3和USP43基因多态性与眼肌面积性状的关联分析

作     者：侯任达 张润 牛乃琪 杨曼 黄晓宇 李慧慧 张龙超 HOU Renda;ZHANG Run;NIU Naiqi;YANG Man;HUANG Xiaoyu;LI Huihui;ZHANG Longchao

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 山西农业大学动物科学学院晋中030801 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2022年第53卷第12期

页      面：4197-4206页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2021YFD1301101) 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202006-04) 国家生猪产业技术体系(CARS-35)。 

主　　题：北京黑猪 FUBP3 USP43 眼肌面积 

摘      要：旨在研究上游远端元件结合蛋白3(far upstream element binding protein 3,FUBP3)及泛素特异性蛋白酶43(ubiquitin specific protease 43,USP43)基因多态性与北京黑猪眼肌面积性状的关系,从而在分子水平指导北京黑猪的育种工作。本研究选取408头北京黑猪收集眼肌面积性状数据并采集肉样提取DNA,根据FUBP3和USP43基因序列设计43对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAstar软件分析测序结果,对FUBP3和USP43基因不同基因型与北京黑猪眼肌面积性状进行关联分析并运用荧光定量PCR对两基因进行基因表达差异分析。在FUBP3基因启动子区共有8个突变,其中rs701769847GA与5~6肋眼肌面积和最后肋眼肌面积均关联显著(PG仅与5~6肋眼肌面积关联显著(PC、rs339464012TC和rs326069041TC只与最后肋眼肌面积关联显著(PA位点GG型个体的FUBP3基因mRNA水平显著低于AA型个体(PT和剪切区的rs323463345GA均只与最后肋眼肌面积关联显著(PA中GG型个体和AA型个体的USP43基因mRNA水平差异不显著。上述两基因中共有两个位点与5~6肋眼肌面积性状关联显著(P0.05),6个位点与最后肋眼肌面积性状关联显著(P0.05),可以作为北京黑猪眼肌面积性状变异的候选基因功能位点,也可以作为潜在的眼肌面积性状分子标记。