云南中甸地区3个牛种PRNP基因23bp和12bp位点的InDel多态性与表达水平

作     者：和晓明 Sameeullah MEMON 刘兴能 岳丹 邓卫东 席冬梅 HE Xiaoming;Sameeullah MEMON;LIU Xingneng;YUE Dan;DENG Weidong;XI Dongmei

作者机构：云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南农业职业技术学院云南昆明650031 

出 版 物：《家畜生态学报》 (Journal of Domestic Animal Ecology)

年 卷 期：2022年第43卷第8期

页      面：13-19页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 090601[农学-基础兽医学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家自然基金项目(31860634) 

主　　题：中甸 PRNP 朊病毒 插入缺失 

摘      要：为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型,比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异,并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平,分析基因型与基因表达水平的关系。结果表明:中甸牦牛的23 bp InDel缺失纯合(-/-)基因型频率最高(0.838),插入等位基因频率极低(0.09),中甸犏牛(0.467)和中甸黄牛(0.399)的缺失纯合基因型频率也较高;而在12 bp InDel中,3种牛的插入纯合(+/+)基因型频率很高,缺失等位基因频率较低;中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23~-12~+为主,频率为0.794和0.444,而中甸黄牛主单倍型为23^(+)12^(-),频率为0.434。性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响(P0.05);3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著(P0.05),可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关。研究揭示,23 bp InDel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的,而在12 bp InDel中,缺失等位基因频率和基因型频率均较低,对比以往认为的BSE抗病单倍型23^(+)12^(+),中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23^(-)12^(+)为主,中甸黄牛以23^(+)12^(-)为主,可通过育种改良筛选,培育对BSE有较高抗病性的群体。