2018—2020年福建地区猪瘟病毒E0基因遗传变异分析

作     者：戴爱玲 张鑫杰 林楚云 尹会方 薛少华 刘建奎 杨小燕 DAI Ailing;ZHANG Xinjie;LIN Chuyun;YIN Huifang;XUE Shaohua;LIU Jiankui;YANG Xiaoyan

作者机构：龙岩学院生命科学学院龙岩364000 福建省生猪疫病防控工程技术研究中心龙岩364000 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室龙岩364000 

出 版 物：《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)

年 卷 期：2024年第32卷第2期

页      面：201-207页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：中央引导地方科技发展专项(2021L3028) 福建省科技重大专项项目(2019NZ09005) 龙岩市科技计划重大项目(2019LY1001) 上杭县奇迈科技创新基金项目(2019SHQM06) 

主　　题：猪瘟病毒 RT-nPCR E0基因 遗传变异 

摘      要：为了了解2018—2020年福建地区猪瘟病毒流行及遗传变异情况,收集福建省不同地区临床发病猪的血液和肺脏、脾脏、淋巴结等组织样本1464份,采用RT-nPCR的方法对样品进行CSFV检测,对部分CSFV阳性样品E0基因进行克隆测序。结果显示,CSFV总体阳性率为1.9%(29/1464),并获得13株CSFV E0基因序列。同源性分析发现所得13株CSFV E0基因之间的同源性在82.2%-99.7%,其中11株CSFV E0基因与1.1亚型代表毒株HCLV的核苷酸同源性为99.0%~99.9%,与Shimen株的核苷酸同源性94.1%~95.0%;1株与2.1c型参考毒株HNSD-2012核苷酸同源性为98.2%;1株与2.1d亚型毒株CSFV/JPN/2018核苷酸同源性为99.6%。遗传进化分析发现,10株CSFV与HCLV、C-ZJ-2008、Shimen和Brescia处于同一分支,属于1.1亚型;1株CSFV与HNSD-2012等位于同一分支,属于2.1c亚亚型;1株与CSFV/JPN/2018等位于同一分支,属于2.1d亚亚型。氨基酸序列分析发现,13株毒株与HCLV等代表毒株在重要的Rnase活性位点高度保守,其中2株2.1亚型毒株与HCLV毒株相比,其在第35位非关键氨基酸残基上发生由G→E的突变。结果表明福建地区CSFV流行情况趋向多样化,提示仍需加强对CSFV流行及遗传变异的持续监测,为猪瘟的诊断及有效防控奠定基础。