基于WGCNA鉴定子宫颈鳞状细胞癌CD8^(+)T细胞浸润相关的生物标志物

作     者：凡志祥 李坤 张彦彦 左世凯 黄冬梅 Fan Zhixiang;Li Kun;Zhang Yanyan

作者机构：郑州大学第二附属医院妇产科河南郑州450014 郑州大学第二附属医院肿瘤科河南郑州450014 

出 版 物：《中国现代医药杂志》 (Modern Medicine Journal of China)

年 卷 期：2022年第24卷第7期

页      面：49-56页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：子宫颈鳞状细胞癌 CD8~+T细胞 CD3E WGCNA 

摘      要：目的应用生物信息学的方法构建促进子宫颈鳞状细胞癌(CSCC)中CD8+T细胞浸润的相关基因共表达网络,并鉴定出相应的预后生物标志物。方法应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和PPI网络探索TCGA数据库中CSCC的基因表达数据,并筛选出与CD8+T细胞浸润相关hub基因,系统分析hub基因的免疫特征及预后价值。结果通过WGCNA和PPI网络分析鉴定出10个hub基因(CCL5、CCR5、CD2、CD3D、CD3E、CD8A、CXCR3、IFNG、PDCD1、PRF1)。在TISIDB数据库中查询10个基因与免疫细胞之间的相关性,发现这些基因的表达与免疫细胞,尤其是CD8^(+)T细胞显著正相关。通过Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox回归分析验证后选择CD3E作为CSCC预后生物标志物。基因集富集分析(GSEA)显示CD3E在细胞黏附分子、趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用和T细胞受体信号通路显著富集。结论通过生物信息学验证,CD3E被确定为CSCC免疫治疗的潜在生物标记物和免疫治疗靶点。