基于线粒体D-loop区的广东沿岸和三沙海域绿海龟遗传多样性分析

作     者：陈华灵 叶明彬 谢子强 肖宝华 廖宝林 王付民 王少锋 姜怡薇 CHEN Hua-ling;YE Ming-bin;XIE Zi-qiang

作者机构：广东惠东海龟国家级自然保护区管理局广东惠州516359 广东海洋大学深圳研究院广东深圳518108 深圳市碧海蓝天海洋科技有限公司广东深圳518108 

出 版 物：《浙江海洋大学学报（自然科学版）》 (Journal of Zhejiang Ocean University：Natural Science)

年 卷 期：2022年第41卷第4期

页      面：349-356页

学科分类：0710[理学-生物学] 070703[理学-海洋生物学] 07[理学] 0707[理学-海洋科学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：广东省海洋经济发展(海洋六大产业)专项资金项目(GDNRC2020040) 广东省林业科技创新项目(2021KJCX008) 

主　　题：绿海龟 D-loop 遗传多样性 

摘      要：通过线粒体调控区D-loop基因部分序列对广东沿岸和三沙海域3个地理群体(广东惠东海龟国家级自然保护区、广东粤西和海南省三沙市)共132个绿海龟样本进行遗传多样性研究。结果表明,3个绿海龟地理群体的D-loop基因片段序列的A+T含量为68.2%,碱基组成具有明显的偏向性;共定义了19个单倍型,单倍型多样性在0.157~0.775之间,核苷酸多样性在0.00063~0.01017之间;3个群体间存在一定的分化,其中三沙群体和其他2个群体存在高度的分化,粤西群体和海龟保护区群体存在较小的分化,3个群体之间存在基因交流现象;采用邻位连接法(NJ)对132个序列片段和19个单倍型分别构建了系统发育树,3个群体的绿海龟存在较为复杂的交叉聚类现象,19个单倍型聚类为3个大的分支。本研究结果表明本研究的绿海龟总体样本具有较高的遗传多样性,广东沿岸与三沙海域的绿海龟种群存在基因交流现象。本研究为探究我国绿海龟种群遗传多样性和开展绿海龟种质资源保护奠定理论基础。