基于GEO数据库的多发性骨髓瘤细胞焦亡预后分析

作     者：李洁 周合冰 LI Jie;ZHOU Hebing

作者机构：首都医科大学附属北京潞河医院血液科北京101100 

出 版 物：《临床肿瘤学杂志》 (Chinese Clinical Oncology)

年 卷 期：2022年第27卷第6期

页      面：506-513页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：多发性骨髓瘤 细胞焦亡 预后 生物信息学分析 

摘      要：目的采用生物信息学分析技术筛选多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)细胞焦亡差异表达基因,并进行预后分析。方法在基因表达谱数据库(GEO)中选取MM细胞焦亡相关基因表达谱芯片数据,采用R软件筛选MM患者肿瘤组织和健康对照组中细胞焦亡差异表达基因。对筛选出的差异表达基因通过Cox回归分析识别预后相关基因,进行预后分析。结果以GSE6477基因表达谱数据集为分析对象,选取与焦亡相关基因匹配共获得焦亡相关基因。将29个差异基因进行预后分析,14个基因(INAVA、P2RY2、NES、NFIX、SPATA17、NLRP2、INHBC、GZMB、CCDC74A、TNF、SNHG28、MUC1、NANOS1、CD6)纳入风险模型构建,生存分析显示年龄、肿瘤分期、风险评分与MM患者预后显著相关。结论通过生物信息学方法,构建了14个细胞焦亡相关基因的MM预后模型,可能为MM患者的个体化治疗和评估提供参考。MM细胞焦亡基因通过生物学过程影响预后。