河北部分地区猪圆环病毒2型分离鉴定及遗传变异分析
Isolation,identification and phylogenetic analysis of porcine circovirus type 2 in Hebei Province作者机构:河北农业大学动物医学院河北保定071001 河北省兽医生物技术创新中心河北保定071001
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2022年第42卷第5期
页 面:853-861页
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:河北省重点研发计划资助项目(19226622D) 河北省农业产业技术体系生猪创新团队资助项目(HBCT2018110207)
摘 要:为了解河北省猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)基因型感染及遗传变异情况,对采自河北省6个不同地区的32份疑似PCV2感染的组织通过PCR进行初步鉴定,并将鉴定为阳性的组织通过接种PK-15细胞分离病毒,通过PCR、间接免疫荧光、透射电镜对分离的病毒进行鉴定,利用特异性引物对PCV2进行PCR全基因序列扩增,测序后进行全基因及ORF2基因核苷酸序列分析。结果显示,32份疑似样品中有13份PCV2阳性组织,阳性率为40.65%。对其中1份仅感染PCV2的样品进行病毒的细胞分离及后续鉴定,得到1株可稳定感染和增殖的PCV2毒株。将初步筛选的阳性组织进行PCV2全基因扩增并测序,得到8株PCV2全基因序列,基因组全长均为1768 bp;8株PCV2全基因同源性比对结果为95%~99.8%,ORF2同源性比对结果为94%~100%;遗传进化分析显示,8个分离株归属于3个基因亚型(PCV2a、PCV2b和PCV2d),同源性氨基酸序列分析显示主要变异区在47~63 aa抗原表位区。本试验结果为进一步研究该地区PCV2分子流行病学及相关疾病的免疫防控奠定了基础。