西农关中奶山羊PDCD4基因的克隆与组织表达分析

作     者：逄国梁 张海荣 王战航 朱俊儒 安小鹏 PANG Guoliang;ZHANG Hairong;WANG Zhanhang;ZHU Junru;AN Xiaopeng

作者机构：陕西省畜牧技术推广总站陕两西安710014 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 

出 版 物：《畜牧与兽医》 (Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2022年第54卷第7期

页      面：1-6页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：陕西省重点研发计划(2020ZDLNY02-01,2021NY-001,2021ZDLNY02-01,2021ZDLNY02-06) 陕西省农业科技创新转化项目(NYKJ-2020-YL-05,NYKJ-2020-YL-04) 

主　　题：关中奶山羊 PDCD4 生物信息学 组织表达 

摘      要：旨在研究程序性细胞死亡因子4(PDCD4)基因与奶山羊乳腺发育的关系。应用RT-PCR技术克隆PDCD4基因编码区(CDS)序列,并进行生物信息学分析,运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测不同组织mRNA相对表达量。结果表明:克隆获得的关中奶山羊PDCD4基因CDS序列长1 410 bp,编码469个氨基酸,分子质量为51.8 ku,分子式为C_(2245)H_(3606)N_(656)O_(230)S_(79),理论等电点为5.03;编码蛋白含有4个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点及53个潜在的磷酸化位点;PDCD4蛋白为亲水性酸性蛋白质,无信号肽,无跨膜结构域;系统进化树显示PDCD4蛋白的氨基酸序列在不同物种间相似度较高,奶山羊与绵羊、牛、猫、猪、弯角大羚羊、美洲白尾鹿等同源性均在90%以上,其中与绵羊的亲缘关系最近;蛋白互作分析显示PDCD4蛋白能与EIF4A1、EIF4G1、PTEN、EIF4A2、EIF4B、RECK、GMPS、EEF1G等蛋白相互作用;qRT-PCR结果显示PDCD4基因在奶山羊各组织中均有表达,在乳腺组织中的表达量最高,其次为肺,在肌肉组织中几乎不表达。本研究为山羊乳腺功能的研究提供了一定的参考资料。