人参bZIP基因家族生物信息学分析

作     者：王思嘉 孙嘉莹 刘美琦 任伟超 于欣欣 刘秀波 马伟 WANG Si-jia;SUN Jia-ying;LIU Mei-qi;REN Wei-chao;YU Xin-xin;LIU Xiu-bo;MA Wei

作者机构：黑龙江中医药大学药学院黑龙江哈尔滨150040 黑龙江中医药大学佳木斯学院黑龙江佳木斯154007 教育部北药基础与应用研究重点实验室黑龙江哈尔滨150040 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2022年第53卷第9期

页      面：2786-2794页

核心收录：

学科分类：1006[医学-中西医结合] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基　　金：黑龙江省“头雁”团队项目(黑龙江省头雁行动领导小组文件 5号) 黑龙江中医药大学科研基金项目(中药健康相关产品研发及产业化专项)(2019BJP06)。 

主　　题：人参 bZIP 生物信息学 基因家族 盐胁迫 干旱胁迫 

摘      要：目的通过人参bZIP基因家族生物信息学分析,为人参功能基因开发利用提供理论依据。方法运用PlantTFDB数据库预测人参基因组中b ZIP基因;通过ExPASy网站得到人参bZIP基因家族信息和特征;使用MEME网站对PgbZIP基因家族保守基因序列进行分析;运用MEGA软件建立PgbZIP基因家族系统进化关系;利用TBtools软件进行PgbZIP表达分析。结果人参基因组中含有157个bZIP基因家族成员,其中152个定位在细胞核,其余5个分别定位在叶绿体和内质网,相对分子质量在14009.93~83440.38,等电点在4.53~10.05,氨基酸数目在120~760 aa,除PgbZIP157以外,均为亲水蛋白。PgbZIP131在干旱胁迫下的表达量为83.47;PgbZIP99在根和盐胁迫条件下表达量均最高,分别为119.82和117.86;PgbZIP117在叶中表达量为48.54;花中PgbZIP106表达量最高为79.55;成熟果实中表达量最高是PgbZIP118,为119.32;PgbZIP101在未成熟果实中的表达量最高,且为65.32。结论推测PgbZIP99与同源基因AtbZIP11功能相似,可以调控根的分生组织活性;PgbZIP131在干旱胁迫条件下表达量最高,推测PgbZIP131对干旱胁迫有重要调控作用;A亚族成员ABF2/AREB1(AtbZIP36)、ABF3(Atb ZIP37)、ABF4/AREB2(AtbZIP38)参与干旱胁迫和盐胁迫调控,推测与A亚族成员具有同源关系的PgbZIP74、PgbZIP132、PgbZIP122、PgbZIP112在干旱胁迫和盐胁迫条件下具有相似调控作用。