利用连接酶检测反应检测碎片化新冠病毒S基因D614G突变

作     者：张新亚 张建 卢辰 薛勇 罗志丹 ZHANG Xinya;ZHANG Jian;LU Chen;XUE Yong;LUO Zhidan

作者机构：江苏海洋大学江苏省海洋药物活性分子筛选重点实验室连云港222005 江苏省海洋资源开发研究院(连云港)连云港222005 

出 版 物：《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期：2022年第39卷第3期

页      面：107-110页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31501763) 

主　　题：连接酶检测反应 新冠病毒 碎片化 D614G突变 

摘      要：新型冠状病毒(SARS-CoV-2)S基因D614突变导致病毒感染能力显著增强,也是德尔塔变异毒株的主要来源。如何在病毒核酸检测时对此类高危SNP进行快速分型是研究者非常关注的技术问题。但新冠病毒属于单链RNA病毒,基因组易降解,现有的点突变鉴定技术并不适用高度降解的碎片化病毒核酸。研究利用连接酶检测反应(LDR)技术结合荧光定量PCR,建立一种检测碎片化新冠病毒S基因D614G的方法。结果表明:方法对5 pmol/L的病毒RNA模板具有良好的区分度,最低可检测出长度仅为40 nt的病毒RNA所携带的点突变。