沙眼衣原体PmpH基因克隆及生物信息学分析

作     者：常月立 王威 孙克 石岩丽 李小俊 张存辉 张玉妥 CHANG Yue-li;WANG Wei;SUN Ke;SHI Yan-li;LI Xiao-jun;ZHANG Cun-hui;ZHANG Yu-tuo

作者机构：河北北方学院医学检验学院河北张家口075000 保定市第一中心医院检验科河北保定071000 中国人民解放军第二五二医院检验科河北保定071000 张家口市宣化区中医院河北张家口075000 

出 版 物：《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期：2022年第32卷第3期

页      面：291-296页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：河北省高等学校科学研究项目-青年基金项目(Z2018030) 

主　　题：沙眼衣原体 PmpH基因 PmpH蛋白 克隆 生物信息学分析 B细胞抗原表位 

摘      要：[目的]克隆沙眼衣原体PmpH基因并进行生物信息学分析。[方法]以沙眼衣原体核酸检测阳性泌尿生殖道标本为研究对象,设计引物扩增PmpH基因,克隆、测序后获得其全长核酸序列,应用生物信息方法预测分析编码蛋白的理化性质、主要结构域、结构及B细胞抗原表位。[结果]PCR扩增出沙眼衣原体PmpH基因,克隆并测序后获得PmpH基因核酸序列,长度为3051 bp,预测PmpH蛋白理论分子质量为107.898 ku,等电点为6.05,该蛋白具有信号肽和2个结构域。PmpH蛋白二级结构主要为无规则卷曲,占比高达50.69%。预测该蛋白含有34条线性B细胞表位,其中氨基酸数大于7的有26个。[结论]克隆得到沙眼衣原体PmpH基因,预测PmpH蛋白分子量为107.898 ku,二级结构主要为无规则卷曲,含有34条线性B细胞表位(大于7个氨基酸的有26个)。