基于锚定PCR技术对10种重要农业害虫微卫星DNA位点的筛选及其特征分析

作     者：李慧 郎坤玲 沈长朋 李洁 陶云荔 褚栋 Hui LI;Kun-ling LANG;Chang-peng SHEN;Jie LI;Yun-li TAO;Dong CHU

作者机构：青岛农业大学农学与植物保护学院山东省植物病虫害综合防控重点实验室山东青岛266109 

出 版 物：《生物安全学报》 (Journal of biosafety)

年 卷 期：2014年第23卷第1期

页      面：60-65页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：国家科技支撑计划课题(12BAD19B06) 青岛市科技发展计划项目(13-1-3-108-nsh) 中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-YW-NF-02) 泰山学者建设工程专项经费 

主　　题：农业害虫 微卫星 5′锚定PCR技术 克隆 特征分析 

摘      要：微卫星DNA广泛存在于真核和原核生物的基因组中，具有多态性丰富、易于检测等特点，在遗传图谱的构建、动植物遗传学育种等方面被广泛应用。利用5′锚定PCR技术对桃小食心虫、桃蛀螟、玉米螟、二点委夜蛾、花蓟马、黄胸蓟马、棕榈蓟马、斑翅果蝇、稻水象甲、扶桑绵粉蚧10种重要农业害虫进行微卫星DNA筛选，并分析各个物种的微卫星DNA的特点。不同物种的阳性克隆率、微卫星比率、克隆效率和冗余率存在不同程度的差异；在核苷酸碱基数目上，主要为二核苷酸重复序列，占重复位点总数的93．2％～100％，三、四核苷酸重复位点较少。在二核苷酸重复位点中， CA/TG重复位点最为丰富，占重复位点总数的89．2％～100％。这与使用的锚定引物密切相关；10种害虫的微卫星DNA平均重复次数为6．7～8．9次，其中玉米螟具有最高的微卫星DNA重复次数（34次）；在序列类型上，完全型序列占上述害虫序列总数的91．0％～100％。5′锚定PCR技术能够快速挖掘害虫的微卫星DNA位点，本研究结果为这些害虫微卫星位点的进一步利用奠定了基础。