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肝癌生物样本库的标准化建立与信息化管理

Standardized establishment and informationized management of liver cancer biobank

作     者:喻晶晶 肖巍 李娅妮 张必翔 陈孝平 舒畅 YU Jingjing;XIAO Wei;LI Yani;ZHANG Bixiang;CHEN Xiaoping;SHU Chang

作者机构:华中科技大学同济医学院附属同济医院肝脏外科中心武汉430000 

出 版 物:《临床肝胆病杂志》 (Journal of Clinical Hepatology)

年 卷 期:2022年第38卷第5期

页      面:1092-1096页

学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基  金:国家科技重大专项(2012ZX10002010-001) 中国工程科技发展战略湖北研究院咨询项目(HB2021C13)。 

主  题:肝肿瘤 数据收集 生物样本库 

摘      要:目的建立一个小型的拥有标准化操作流程和信息化管理功能的肝癌生物样本库。方法根据纳排标准,在患者签署知情同意书基础上,收集2012年8月—2020年12月就诊于华中科技大学同济医学院附属同济医院肝脏外科的肝癌患者血液、组织和粪便样本,并按照全血、血清、冻存组织、石蜡包埋组织和粪便等不同样本的标准流程进行出入库管理,同时采集患者临床信息及其随访信息。通过随机抽取不同年份的肝癌及癌旁冷冻组织样本,检测总RNA的浓度和完整性,确保样本库冷冻样本保存质量。结果101个自然月共收集4190例肝癌手术患者样本,其中包括41718份冷冻组织样本、18950份石蜡包埋组织样本、24389份全血样本、20060份血清样本和5392份粪便样本。所收集肝癌患者的年龄范围是13~88岁,男性占比85.1%,乙型肝炎和肝硬化的比例分别是83.3%和73.5%。根据样本的收集、处理、保存、应用及信息化管理,制定出一份标准的操作流程(SOP)和一套电子数据采集系统(EDC)。从样本库随机抽取的18份冷冻组织样本中,其中16份样本RNA质量较高,可满足后续实验需求。结论建立了标准化和信息化的肝癌生物样本库,为肝癌基础研究提供了高质量的样本保障,能挖掘样本更多的研究价值。

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