南瓜蚜传黄化病毒基因组遗传多样性分析

作     者：崔正秀 孙柳清 肖苗苗 王燕飞 罗永平 赫娟 玉山江·麦麦提 陈伟 CUI Zheng-xiu;SUN Liu-qing;XIAO Miao-miao;WANG Yan-fei;LUO Yong-ping;HE Juan;YUSHANJIANG Mai-maiti;CHEN Wei

作者机构：山西师范大学生命科学学院山西临汾041000 新疆农业科学院乌鲁木齐830052 

出 版 物：《西南农业学报》 (Southwest China Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2022年第35卷第2期

页      面：366-372页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：新疆农业科学院优秀青年科技人才基金项目(xjnky-2012-038) 

主　　题：CABYV 基因组克隆 遗传多样性 

摘      要：【目的】研究南瓜蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)的分子特征、遗传结构和进化机制,对于明确该病毒病在田间发生的流行规律和制定长期可持续的防控策略具有重要意义。【方法】从新疆阿克苏市随机采集了疑似感染CABYV的120份甜瓜叶片,采用RT-PCR方法进行病毒检测,序列采用MEGA 7.0构建系统发育树,使用DnaSP v5.10分析不同序列之间的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件分析CABYV序列可能发生的重组事件。【结果】经RT-PCR验证,38个样品为CABYV阳性,检出率为31.67%。从这些阳性样品中分离、测序、克隆得到了一个新的CABYV-2分离物。该分离物基因组长度为5497 bp,编码6个开放阅读框。与NCBI数据库中的来自不同国家的23个CABYV分离物相比,CABYV-2与KR231942.1的同源性最高,与JF939812.1的同源性最低。进化树分析结果表明,24个分离物由于地理因素的不同被分为2个分支,其中CABYV-2与KR231942.1聚在一起,属于分支1。遗传多样性与中性检验结果说明CABYV存在高度变异且种群不断扩展。重组分析结果表明,有EU636992.1和KR231949.1两个重组事件,重组加剧了CABYV的变异。【结论】CABYV在我国分布广泛且种群不断扩展,成为瓜类植物生产的限制因素。CABYV新疆阿克苏市分离株与韩国分离株KR231942.1亲缘关系最近,与来自欧洲国家的分离株亲缘关系最远,分支1和分支2分离株之间存在较大的遗传差异,CABYV在不同宿主间的重组加剧了CABYV的变异,重组和负选择可能是影响CABYV遗传变异的重要原因。