湖南省华中樱群体遗传结构和多样性分析

作     者：严佳文 柏文富 李建挥 禹霖 聂东伶 熊颖 吴思政 YAN Jia-wen;BAI Wen-fu;LI Jian-hui;YU Lin;NIE Dong-ling;XIONG Ying;WU Si-zheng

作者机构：湖南省植物园长沙410116 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2022年第23卷第2期

页      面：376-384页

核心收录：

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：湖南省林业科技创新杰出青年培养科研项目(XLK202108-6) 国家林业和草原局林业科技发展中心项目(KJZXSA2019037) 湖南省林业科技创新专项(XLK201914) 

主　　题：华中樱 ITS 遗传多样性 遗传结构 

摘      要：华中樱是原产于我国的野生樱花,湖南省是其主要分布区域,开展湖南省华中樱遗传多样性研究,可为种质资源保护及开发利用奠定基础。通过对核糖体基因转录间隔区(ITS,internal transcribed spacer)序列进行PCR扩增和测序,应用遗传学软件分析了湖南省10个华中樱群体207份个体的遗传多样性和遗传结构。结果表明,湖南省华中樱的总体核苷酸多样性为0.0056,单倍型多样性为0.763,207份种质资源可分为14个单倍型,其中来自怀化市中方县的群体遗传多样性最高,其次是来自衡阳市南岳区的群体,来自郴州市苏仙区的群体的遗传多样性最低。分子方差分析(AMOVA,analysis of molecular variance)结果表明,60%的遗传变异存在于华中樱群体间,40%存在于群体内,大部分群体之间存在较大的遗传分化,其中来自常德市石门县和来自郴州市苏仙区的群体的遗传分化指数高达0.96571。中性检验结果表明,Tajima′s D(1.02121)和Fu and Li′s D(1.07527)均为正值,但统计检验不显著(P0.10);错配分布分析结果显示,错配分布呈双峰曲线,表明湖南省华中樱群体遵循中性进化模式,且进化过程中可能经历了平衡选择或突然群体收缩。Mantel test检验表明,群体之间的地理距离与遗传距离存在显著的正相关性(r=0.3356,P=0.0260.05)。湖南省华中樱种质资源遗传多样性水平较高,群体间遗传分化明显且符合距离隔离模型。