2016-2020年华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查
Molecular epidemiology of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in North China from 2016 to 2020作者机构:河北农业大学动物医学院河北保定071001 河北省兽医生物技术创新中心河北保定071001 邢台市邢东新区动物卫生监督所河北邢台054001
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2022年第42卷第1期
页 面:12-19页
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:河北省重点研发计划资助项目(19226622D) 河北省农业产业技术体系生猪创新团队资助项目(HBCT2018110207)
主 题:猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 遗传变异分析 华北地区 分子流行病学
摘 要:利用RT-PCR方法对2016-2020年华北地区692份疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)临床样本进行检测,获得368份阳性样品,阳性率为53.18%,并对其进行了ORF5基因扩增和测序,开展遗传变异和分子流行病学分析。结果显示,共获得33条完整的ORF5基因序列,除了HB-XT株为600 bp,其余全长均为603 bp。ORF5基因遗传进化分析表明33株均为Ⅱ型,其中有9株分布在Lineage 8,24株分布在Lineage 1。33株之间的氨基酸序列同源性为80.1%~99.5%,与JX-A1株和NADC30株的同源性分别为81.1%~99.5%和85.6%~94.5%。氨基酸分析结果表明,33株均在诱骗表位和中和表位发现了突变;在33株中共发现7个N-糖基化位点,其中包括相对保守的N44和N51位点,以及主要位于抗原表位的N30,N32,N33,N34和N35位点。结果表明,2016-2020年华北地区HP-PRRSV毒株逐渐被类NADC30毒株所取代,成为优势毒株,且ORF5基因变异差异较大,使PRRSV流行变得更加复杂。因此,本研究对PRRS分子流行病学以及疫苗的选择和防控具有重要的意义。